辞退员工补偿标准应按应发工资计算。以下是对此结论的详细分析：

一. 经济补偿计算基础的法律规定

• 根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条，经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。这一规定明确了应发工资作为经济补偿的计算基础。

二. 应发工资与实发工资的区别

• 应发工资：是劳动者在提供正常劳动的情况下，用人单位按照劳动合同约定或者国家规定，应当支付给劳动者的工资报酬，它全面、真实地反映了劳动者的工资收入情况。
• 实发工资：是在应发工资基础上扣除了社保、公积金个人缴纳部分以及个人所得税等款项后的实际到手金额。

三. 为何选择应发工资作为计算基础

• 使用应发工资作为经济补偿的计算基数，能更准确体现劳动者为用人单位创造的价值以及其劳动报酬水平，从而确保劳动者在失业后能够获得更为合理的经济补偿，保障其基本生活需求。
• 若按实发工资计算，可能会因扣除项目导致金额低于劳动者实际劳动所得，对劳动者权益造成损害。

四. 实际操作建议

• 为避免后续纠纷，建议用人单位在劳动合同中明确约定经济补偿金的计算方式，确保双方权益得到明确保障。
• 劳动者在面临被辞退的情况时，应了解自己的权益和应得的补偿标准，积极主张按照应发工资来计算经济补偿。

综上所述，辞退员工的补偿标准应按应发工资计算，这既符合法律法规的规定，也能更好地保障劳动者的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。