水果店售卖农药超标的，将由县级以上人民政府食品安全监督管理部门进行处罚，具体包括没收违法所得和违法经营的水果，并可以没收用于违法经营的工具、设备、原料等物品；同时根据违法经营的水果货值金额处以相应罚款，情节严重的，还可能被吊销许可证。以下是详细分析：
违法行为的认定：
- 根据《中华人民共和国食品安全法》第一百二十四条的规定，生产经营农药残留超过食品安全标准限量的食品，属于违法行为。水果店售卖农药超标的水果，即触犯了这一法律规定。
处罚措施：
- 没收与罚款：县级以上人民政府食品安全监督管理部门将没收水果店的违法所得和违法经营的水果，并可以没收用于违法经营的工具、设备、原料等物品。同时，根据违法经营的水果货值金额，处以五万元以上十万元以下罚款（货值金额不足一万元的情况），或货值金额十倍以上二十倍以下罚款（货值金额一万元以上的情况）。
- 吊销许可证：如果情节严重，如多次违法或造成严重后果，食品安全监督管理部门还可能吊销水果店的许可证。
实际案例理解：
- 假设一家水果店因售卖农药超标的水果被查处，其违法经营的水果货值金额为2万元。那么，该水果店将面临货值金额十倍以上二十倍以下的罚款，即20万元至40万元的罚款，并且可能被没收违法所得、违法经营的水果以及用于违法经营的工具、设备等。如果情节严重，还可能被吊销许可证，从而无法继续经营。
综上所述，水果店售卖农药超标的，将面临严格的法律处罚。因此，我建议水果店经营者应严格遵守食品安全法律法规，确保销售的水果符合食品安全标准，以避免不必要的法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。