卫生院可以给盖三方协议章。以下是具体分析：

一. 三方协议的性质与盖章要求

1. 三方协议的定义：三方协议是《全国普通高等学校毕业生就业协议书》的简称，它是明确毕业生、用人单位、学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面合同。

2. 盖章要求：根据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，具备法律效力的民事法律行为需满足行为人具有相应民事行为能力、意思表示真实、不违反法律及行政法规的强制性规定等条件。三方协议作为具有法律效力的合同，需三方（学生、用人单位、学校）认可并签字或盖章才生效。对于用人单位而言，一般应加盖公章，以表明单位对协议的认可和参与。

二. 卫生院作为用人单位的盖章权限

1. 卫生院的法律地位：卫生院作为医疗机构，具有独立的法人资格，能够以自己的名义独立进行民事活动，并承担相应的民事责任。

2. 盖章权限：根据一般单位公章使用管理制度，单位公章是对外进行事务处理的主要印章，具有较高的法律效力。卫生院作为用人单位，在三方协议上加盖公章是符合法律规定的，能够代表单位对协议的认可和承担相应责任。

三. 特殊情况下的盖章

1. 实习部门的章：虽然一般情况下应加盖单位公章，但在某些特殊情况下，如实习生在卫生院实习并需要签订三方协议时，实习部门的章（如医务科章）也可能被视为有效。这通常需要基于卫生院内部的管理规定和与学校的沟通协商。

2. 注意事项：在特殊情况下使用实习部门章时，应确保该章的使用得到了卫生院的正式授权，并符合学校的要求。同时，为了避免潜在的纠纷，建议在盖章前与学校和卫生院的相关部门进行充分沟通。

我的建议：

• 如果你是实习生，需要在卫生院实习并签订三方协议，建议首先与学校和卫生院的相关部门进行沟通，明确盖章的具体要求和流程。
• 在确保得到正式授权的情况下，卫生院可以加盖公章或实习部门的章在三方协议上。
• 如有进一步需要，您可以继续咨询我。