三方协议是否可以盖村卫生所的章，需分情况讨论，核心取决于村卫生所的法律地位及协议内容是否在其权限范围内：

1. 若村卫生所为独立法人或具备独立民事主体资格
   根据《民法典》第六十条，若村卫生所已依法登记为事业单位法人、社会服务机构法人（如民办非企业单位）或取得医疗机构执业许可证的独立主体，其公章具有法律效力。此时需进一步判断：

   • 协议内容与村卫生所职能相关：如三方协议涉及基层医疗服务合作、公共卫生项目等村卫生所法定职责范围内的业务（依据《医疗机构管理条例》第十五条），盖章行为合法有效。
     
   • 协议内容超出村卫生所权限：若协议涉及金融投资、工程建设等非医疗领域，且村卫生所未经上级卫生行政部门或主管部门授权，盖章可能因越权而无效，甚至引发表见代理风险。

2. 若村卫生所为村集体内设机构（无法人资格）
   根据《村民委员会组织法》第二条，若村卫生所仅为村集体经济组织或村民委员会下设的医疗服务站点，未独立登记为法人，则其公章仅代表村集体内部管理职能。此时：

   • 需村集体或村委会追认：若协议涉及村集体资产处置、土地使用等重大事项，需加盖村民委员会公章并经村民会议或村民代表会议决议（依据《村民委员会组织法》第二十四条），否则协议效力存疑。
     
   • 仅限内部事务的例外：若协议仅涉及村卫生所日常药品采购、设备租赁等内部管理事项，且未损害村集体利益，可能被认定为有效，但仍建议补充村委会书面同意文件。

3. 实务建议

   • 核查主体资格：要求村卫生所提供《医疗机构执业许可证》及法人登记证书，确认其法律地位。
     
   • 明确协议内容：在协议中列明村卫生所的具体授权范围（如“仅代表甲方签署本协议，不涉及其他权利义务”），避免歧义。
     
   • 补充授权文件：若村卫生所无法人资格，建议要求村委会出具《授权委托书》，明确授权范围及期限。
     
   • 公证或见证：对涉及重大利益的协议，可申请公证机构公证或邀请基层法律服务工作者见证，增强证据效力。

总结：村卫生所盖章的效力需结合其主体资格、协议内容及授权程序综合判断。若您已签署此类协议或面临纠纷，可进一步提供协议文本及村卫生所资质文件，我将协助分析具体风险点。