解除劳动合同补偿金分两次发放，不可以分开申报个税。以下是对此问题的详细分析：

一. 个税申报的原则

根据公开发布的信息，离职补偿金属于一次性补偿收入，原则上应一次性申报个税。尽管双方协商同意可以分次支付补偿金，但在个税申报上，不得分次申报。这意味着，无论补偿金是分几次发放，都应按总的补偿收入数额进行个税申报。

二. 具体规定与实例

1. 国家税务总局的规定：

   • 国家税务总局对于分期支付解除劳务合同补偿金能否分期扣缴个税的问题，并没有明确的规定。但部分税务机关，如广西税务局、大连税务局，已明确表示应按总的补偿收入数额，适用解除劳动合同一次性补偿金有关规定计算个人所得税。

2. 个税计算方式：

   • 根据《财政部 税务总局关于个人所得税法修改后有关优惠政策衔接问题的通知》(财税〔2018〕164号)第五条规定，个人与用人单位解除劳动关系取得的一次性补偿收入（包括经济补偿金、生活补助费和其他补助费），在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税；超过3倍数额的部分，需单独适用综合所得税率表计算纳税。

   • 例如，若某企业与员工解除劳动合同，并约定支付一次性补偿金30万元，分两次发放。那么，在个税申报时，应按这30万元的总额进行计算，而不是分别按两次发放的金额计算。

三. 我的观点

我建议企业在支付解除劳动合同补偿金时，应咨询当地税务机关或专业税务人员，确保个税申报的合规性。尽管双方可以协商分次支付补偿金，但在税务处理上，应遵循一次性补偿收入的原则进行个税申报。这样做不仅可以避免税务风险，还能确保员工的合法权益得到保障。

如有进一步需要，您可以继续咨询我。