该合同条款是否有效，需根据具体情况分析。以下是对此问题的详细分析：

一. 合同条款的有效性分析

1. 一般原则：根据《民法典》的相关规定，合同是双方意思表示一致的产物，只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方具有相应的民事行为能力，合同即有效。
2. 关于赔偿归属的约定：在村民将土地承包给本村村民的合同中，双方约定若有赔偿归承包方所有。这一约定，实质上是双方对土地承包经营权流转过程中可能产生的风险及赔偿责任的分配。只要这一约定是双方真实意思表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定，即应认定为有效。

二. 特殊情况下的无效性

1. 违反法律强制性规定：如果合同中的赔偿约定违反了法律、行政法规的强制性规定，如涉及非法目的、损害社会公共利益等，则该条款无效。
2. 存在欺诈、胁迫等情形：如果合同是在欺诈、胁迫等不正当手段下签订的，或者存在其他导致合同无效的情形，如双方恶意串通等，那么整个合同或相关条款将无效。

三. 结论与建议

• 结论：综上所述，村民将其土地承包给本村村民，并约定若是有赔偿归承包方所有，这一合同条款在一般情况下是有效的。但具体效力还需根据合同的具体内容、签订过程以及是否存在违反法律、行政法规的强制性规定等因素来判断。
• 建议：在签订此类合同时，双方应确保合同内容合法、明确，并充分了解各自的权利和义务。如有必要，可咨询专业律师进行审查和指导，以确保合同的合法性和有效性。同时，双方也应遵守合同约定，诚信履行各自义务，以维护合同的稳定性和可靠性。

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