同一借条两人签字，但签字不是一人所签，法院会根据签字人的真实意思表示及借款用途等综合判断借贷关系的有效性及责任承担。具体分析如下：

一. 签字人身份与责任

1. 共同借款人：如果两人均作为借款人签字（即使不是同一人所签），且借款用于两人共同的事务或共同生活，那么两人通常会被视为共同借款人，对借款承担连带责任。
2. 保证人或见证人：如果其中一人是作为保证人或见证人签字，那么其责任将不同于共同借款人。保证人可能需要承担保证责任，而见证人则一般不承担还款责任，但可能需要作证以证明借款事实。

二. 法院判断依据

1. 签字真实性：法院会首先审查签字的真实性，确认是否确为两人所签。如果签字被伪造或冒用，那么伪造者或冒用者将承担相应的法律责任。
2. 借款用途：法院会考察借款的用途，以判断借款是否用于两人共同的事务或生活。如果借款确实用于两人共同的目的，那么两人更有可能被视为共同借款人。
3. 证据链：法院会综合考察借条、转账记录、聊天记录等证据，以形成完整的证据链，从而判断借贷关系的真实性及责任承担。

三. 法律依据

• 《中华人民共和国民法典》第六百六十七条：借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。
• 《中华人民共和国民法典》第六百六十八条：借款合同应当采用书面形式，但是自然人之间借款另有约定的除外。借款合同的内容一般包括借款种类、币种、用途、数额、利率、期限和还款方式等条款。
• 我的观点：在这些条款下，法院会依据借条的书面内容，结合借款的实际用途和签字人的真实意思表示，来判断借贷关系的有效性及责任承担。

综上所述，同一借条两人签字但签字不是一人所签时，法院会根据具体情况进行综合判断。如果您面临此类问题，建议保留好相关证据，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如有进一步需要，您可以继续咨询我。