关于保证金收取是放在主合同里合适还是补充协议里合适的问题，其实并没有一个绝对的答案，这主要取决于具体的合同情况和双方的协商结果。不过，我可以从以下几个方面来帮你分析这个问题：

1. 主合同与补充协议的法律效力：

   • 主合同是双方就主要条款达成的一致意见，是合同的核心部分。
   • 补充协议则是对主合同中未尽事宜或需要补充的内容进行的约定，它与主合同具有同等的法律效力。

2. 保证金的性质与重要性：

   • 保证金通常作为一种担保方式，用于确保合同的履行或作为违约时的赔偿。
   • 如果保证金对合同的履行至关重要，那么将其放在主合同中可能更为合适，以突出其重要性。

3. 合同的清晰性与可读性：

   • 将保证金条款放在主合同中，可以使合同更加清晰、易于理解。
   • 如果保证金只是合同中的一个次要条款，或者双方希望保持主合同的简洁性，那么将其放在补充协议中也是合理的。

4. 双方协商与灵活性：

   • 合同的制定应充分尊重双方的意愿和协商结果。
   • 如果双方对保证金的收取方式、金额、时间等有特别的约定，那么可以根据实际情况选择将其放在主合同或补充协议中。

综上所述，保证金收取是放在主合同里还是补充协议里，并没有一个固定的答案。它取决于合同的具体情况、双方的协商结果以及保证金在合同中的重要性。因此，在制定合同时，建议双方充分沟通、协商，并根据实际情况做出合理的选择。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以随时向我咨询。