公共汽车站禁止擅自改变用途进行出租的法律依据主要来源于《道路旅客运输及客运站管理规定》（2016年修正本）的相关条款。以下是针对您问题的详细解答：

一、法律依据

根据《道路旅客运输及客运站管理规定》（2016年修正本）第八十九条的规定，客运站经营者不得擅自改变客运站的用途和服务功能。若违反此规定，县级以上道路运输管理机构将责令其改正；拒不改正的，将处以3000元的罚款；若有违法所得，还将没收违法所得。

二、相关责任

1. 立案责任：对于发现的擅自改变客运站用途的案件，道路运输管理机构将进行审查，并决定是否立案。
2. 调查责任：立案后，将指定专人负责调查取证，确保调查过程的公正性和合法性。执法人员需出示执法证件，并听取当事人的辩解陈述。
3. 审查责任：对案件调查报告进行审查，包括违法事实、证据、调查取证程序、法律适用等方面，以确保处罚的准确性和公正性。
4. 告知责任：在作出行政处罚决定前，将制作并送达《行政处罚通知书》，告知当事人违法事实及其享有的陈述、申辩等权利。
5. 决策与执行责任：根据审查结果，作出行政处罚决定，并制作行政处罚决定书。决定书将按法律规定的方式送达当事人，并依照生效的处罚决定执行相应的处罚项目。

三、追责情形

若道路运输管理机构工作人员在执法过程中存在违法行为，如不按规定实施行政许可、参与或变相参与道路客运经营、不及时查处违法行为等，将依法给予行政处分；构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。

综上所述，公共汽车站禁止擅自改变用途进行出租的法律依据明确，且相关责任与追责机制完善。这有助于维护客运市场的秩序和乘客的合法权益。