迟到扣钱超过日薪是不合法的。以下是具体的法律分析：

1. 违反劳动法律法规：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。迟到扣钱超过日薪显然违反了这一规定，构成了对劳动者工资的克扣。
   • 《工资支付暂行规定》第十六条也明确规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可从其工资中扣除赔偿，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。迟到扣钱超过日薪显然超出了这一法定扣除限额。

2. 规章制度需合法合理：

   • 用人单位制定的规章制度必须符合法律规定，且涉及劳动者切身利益的规章制度应经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并向劳动者公示或告知。如果规章制度中的扣款规定超过了法律规定的上限，该条款将因违法而无效。

3. 劳动者权益保护：

   • 劳动者有权向用人单位询问扣款原因，并要求得到合理解释。若扣款原因不明确或不合理，劳动者可以提出异议，并通过协商、投诉、仲裁或诉讼等方式来维护自己的合法权益。

综上所述，迟到扣钱超过日薪是不合法的，违反了劳动法律法规的相关规定。用人单位应依法制定和完善劳动规章制度，确保对劳动者的处罚合理、合法，并充分保障劳动者的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。