运输公司法人未持有安全证，应当立即停止相关的运输业务活动，并尽快按照相关规定申请和办理安全证。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律法规要求

1. 依据相关法规：根据《中华人民共和国安全生产法》及其实施条例，以及特定行业（如道路运输）的相关法规，从事特定行业（尤其是涉及公共安全的行业）的公司法人或主要负责人，通常需要持有相应的安全证书或经过安全培训合格。
2. 安全证的重要性：安全证是证明公司法人或主要负责人具备安全生产知识和管理能力的重要凭证，是保障公司安全生产的重要措施。

二. 未持安全证的法律后果

1. 可能面临处罚：如果运输公司法人未持有安全证而从事相关运输业务，可能面临相关监管部门的行政处罚，包括但不限于罚款、责令停业整顿等。
2. 安全风险增加：未经过安全培训或未持有安全证的法人可能缺乏必要的安全生产知识和管理能力，从而增加公司的安全风险。

三. 应对措施

1. 立即停止相关业务：在未取得安全证之前，运输公司应暂停所有可能涉及安全风险的运输业务，以避免可能的法律后果和安全风险。
2. 尽快申请安全证：公司应尽快按照相关规定和程序向相关部门申请安全证，包括准备必要的申请材料、参加安全培训、通过考试等。
3. 加强内部管理：在等待安全证下发的过程中，公司应加强内部管理，确保各项安全措施得到有效执行，降低安全风险。

我建议：运输公司应高度重视安全证的重要性，确保公司法人或主要负责人尽快取得安全证，以保障公司的合法运营和安全生产。同时，公司也应加强内部安全管理，提高员工的安全意识和管理能力。如有进一步需要，您可以继续咨询我。