针对您提出的“工程财审后已支付工程款不足扣款怎么办”这一问题，首先我们要明确的是，这通常涉及到工程合同款的支付与扣款问题，处理此类问题需依据合同条款及实际履行情况来综合判断。以下是我根据您的描述给出的几点建议：

1. 核查合同条款：

   • 首先，应详细核查工程合同中关于工程款支付、扣款及违约责任的相关条款。这包括支付时间、支付方式、扣款条件及标准等，以确定双方的权利与义务。

2. 沟通协商：

   • 在核查合同条款的基础上，建议与对方（如发包方或承包方）进行友好沟通，明确工程款不足扣款的具体原因，并探讨解决方案。通过协商，双方可以就扣款金额、支付方式及时间等达成一致，从而避免不必要的纠纷。

3. 依据合同条款采取法律措施：

   • 如果沟通协商无果，且合同条款明确规定了扣款不足时的处理方式（如补足差额、支付违约金等），则可以依据合同条款向法院提起诉讼或申请仲裁，要求对方承担相应的法律责任。

4. 考虑实际情况：

   • 在处理此类问题时，还需考虑实际情况，如工程是否已竣工验收、是否存在质量问题、扣款是否合理等。这些因素都可能影响最终的处理结果。

5. 保留证据，备查备用：

   • 无论采取何种方式处理，都应保留好相关证据，如合同文本、支付凭证、扣款通知等，以便在需要时提供证明。

综上所述，处理工程财审后已支付工程款不足扣款的问题，需要综合考虑合同条款、实际情况及双方意愿，通过沟通协商或法律途径寻求解决方案。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。