嫌疑犯被扣押的手机会由看守所代为保管，出所时核对发还或者转监狱、劳动改造机关。具体分析如下：

一. 看守所对扣押物品的处理

• 根据《中华人民共和国看守所条例》第十一条，看守所收押人犯时，应当对其人身和携带的物品进行严格检查。非日常用品应当登记，并代为保管。这意味着，嫌疑犯被扣押的手机，作为非日常用品，会由看守所进行登记并代为保管。

二. 扣押手机的归还与转交

• 同样依据《中华人民共和国看守所条例》第十一条，出所时，看守所会核对并发还代为保管的物品，或者将物品转交监狱、劳动改造机关。这意味着，如果嫌疑犯后续被判处刑罚并送往监狱或劳动改造场所，其被扣押的手机会随之转交；如果嫌疑犯被释放，则其手机会被发还。

三. 特殊情况的处理

• 如果手机被发现含有犯罪证据或可疑物品，看守所会当场制作记录，并由人犯签字捺指印后，送案件主管机关处理。在这种情况下，手机的处理将依据案件主管机关的决定进行。

我的观点：嫌疑犯被扣押的手机会由看守所代为保管，并根据后续情况决定是发还、转交还是送案件主管机关处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。