行驶证的发动机号与交强险上的不一样，属于违法行为。以下是对此问题的详细分析：
一. 法律规定
《中华人民共和国道路交通安全法》第十六条：
- 明确规定，任何单位或者个人不得改变机动车型号、发动机号、车架号或者车辆识别代号。
- 这意味着，行驶证上的发动机号作为车辆的重要识别信息，必须与实际车辆的发动机号保持一致。
《机动车交通事故责任强制保险条例》：
- 规定了机动车交通事故责任强制保险（交强险）的相关内容，其中隐含了保险单上的车辆信息应与实际车辆信息相符的要求。
二. 违法后果
交警处理：
- 如果行驶证的发动机号与交强险上的不一致，交警可能会怀疑车辆存在非法改装、套牌等违法行为，进而扣留车辆。
- 同时，这也可能被视为车辆未按规定投保交强险，导致交警扣留机动车，并处应缴纳的保险费的2倍罚款。
保险公司处理：
- 虽然保险单上的发动机号与实际不符不影响保险合同的效力（在特定情况下，如因保险公司或相关方的过错导致），但保险公司可能以无法核实车辆信息为由拒绝赔偿。
- 然而，在司法实践中，如果更换发动机是保障车辆正常行驶所必需的，且更换后未导致车辆性能、安全标准等方面的变化，法院可能不支持保险公司的拒赔理由。
三. 合规建议
重新办理拓号手续：
- 如果车辆更换了发动机，车主应重新办理拓号手续，确保行驶证上的发动机号与实际车辆一致。
- 这包括准备相关材料（如情况说明、行驶证、机动车登记证明等），前往车管所验证车辆信息，并前往车辆刑侦机构进行再次审核。
及时变更登记：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第六条，更换发动机等涉及车辆重要识别信息变更的情况，车主应及时向车辆管理所申请变更登记。
我建议车主在发现行驶证的发动机号与交强险上的不一致时，应立即采取措施进行更正，以避免可能的法律风险和不必要的麻烦。如有进一步需要，您可以继续咨询我。