项目申请到的专项债资金应由项目单位或项目公司承担偿还责任。以下是对此结论的详细分析：

一. 偿还责任主体

1. 项目单位或项目公司负责偿还：根据《中华人民共和国公司法》第三条，公司是企业法人，有独立的法人财产，并以其全部财产对公司的债务承担责任。在专项债资金的借贷关系中，项目单位或项目公司作为借款人，依法应承担偿还责任。

2. 合同法律关系的约束：根据《中华人民共和国民法典》第四百六十五条，依法成立的合同受法律保护，并对当事人具有法律约束力。专项债资金的借贷行为通常涉及借款合同，该合同明确了借款人和贷款人的权利义务，包括偿还责任。因此，项目单位或项目公司作为借款合同的当事人，必须履行偿还义务。

二. 偿还方式的法律依据

• 根据《中华人民共和国民法典》第六百六十七条，借款合同是借款人向贷款人借款，到期返还借款并支付利息的合同。这表明，项目单位或项目公司在借款到期后，应按照合同约定的方式和期限偿还专项债资金及相应利息。

综上所述，项目申请到的专项债资金应由项目单位或项目公司承担偿还责任。这是基于公司法关于公司独立法人财产权和债务承担的规定，以及民法典关于合同法律关系和借款合同的规定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。