认罪认罚后，案件并不会停止调查。下面我将详细解释这一结论：

1. 认罪口供的核实：

   • 犯罪嫌疑人的认罪口供虽然对案件进展有帮助，但可能存在不真实或遗漏的情况。因此，司法机关需要继续调查，以核实口供的真实性和完整性。

2. 关联犯罪和同案犯的查处：

   • 认罪可能只是案件的一部分，还可能存在其他关联的犯罪行为或同案犯未被发现。继续调查可以深挖犯罪网络和情节，防止遗漏重要的犯罪事实，确保司法公正和社会安全。

3. 法定程序和证据规则的遵循：

   • 调查过程必须遵循法定程序和证据规则，确保每一个环节都合法合规。即使犯罪嫌疑人已经认罪，也不能忽视对整个案件的全面审查和深入调查，以维护法律的尊严和社会的公平正义。

综上所述，认罪认罚后，案件并不会停止调查。司法机关仍会继续进行全面、深入的调查，以确保案件的公正处理。如果你对此类刑事案件有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。