在交通事故中，判断运输公司还是员工承担责任，需要根据具体情况进行综合分析。以下是我从法律角度给出的详细解答：
结论前置：
- 若员工在执行工作任务过程中发生交通事故，且事故并非由员工的故意或重大过失导致，运输公司通常需要承担相应责任。
- 若员工非执行工作任务期间发生交通事故，或存在故意犯罪、重大违规等行为，运输公司可能不承担或仅承担较小责任。
详细分析：
基于交通事故责任的认定：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十三条，公安机关交通管理部门会制作交通事故认定书，明确交通事故的基本事实、成因及当事人的责任。这是判断运输公司是否承担责任的重要依据。
- 若事故责任在运输公司一方，如员工在执行工作任务时造成损害，根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十一条，运输公司作为用人单位需承担侵权责任，并可向有故意或重大过失的员工追偿。
车辆状况与公司管理：
- 若运输公司对所属车辆未尽到维护、保养义务，导致车辆存在安全隐患并引发事故，运输公司需承担相应责任。
- 运输公司在招聘司机时，应严格审查其驾驶资质、技能及健康状况。若因选任不当或缺乏必要的安全教育和管理导致事故，运输公司亦需承担责任。
特殊情形下的责任判定：
- 若运输公司与其他方存在挂靠关系，且挂靠车辆发生交通事故造成损害，属于该机动车一方责任的，当事人有权请求挂靠人和被挂靠人承担连带责任。
- 若员工非执行职务行为导致事故，如私下使用车辆办私事，运输公司一般不承担责任，由员工个人承担法律后果。
- 若员工在事故中存在故意犯罪行为，如酒驾、毒驾等，且这些行为明显超出工作范围和公司可预见的合理行为界限，运输公司有可能减轻或不承担责任。
赔偿范围与标准：
- 若运输公司需承担赔偿责任，赔偿范围通常包括医疗费、护理费、交通费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。若造成残疾或死亡，还应赔偿残疾赔偿金或死亡赔偿金。
- 具体的赔偿金额会根据受害人的实际损失以及相关法律法规的规定来确定。
综上所述，交通事故中运输公司是否承担责任需综合考虑多种因素。在处理相关纠纷时，应充分依据法律规定和实际情况进行公正、合理的裁决。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。