电子凭证具有合法性。具体分析如下：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国电子签名法》第三条，民事活动中的合同或其他文件、单证等文书，当事人可以约定使用电子签名、数据电文，且不得仅因其采用电子形式而否定其法律效力。
   • 《国务院关于在线政务服务的若干规定》第十条也明确指出，电子证照与纸质证照具有同等法律效力。

2. 具体规定：

   • 财政部和国家档案局联合发布的《关于规范电子会计凭证报销入账归档的通知》中明确规定，来源合法、真实的电子会计凭证与纸质会计凭证具有同等法律效力，并详细列出了电子会计凭证报销入账归档的条件和要求。
   • 在税务领域，《中华人民共和国税收征收管理法(修订征求意见稿)》也确立了电子凭证、电子资料的法律效力，为电子税务的推广提供了法律保障。

3. 实际应用：

   • 在电子商务、电子政务等领域，电子凭证如电子发票、电子客票等已广泛应用，并得到了法律的认可。
   • 不动产权证书、不动产登记证明等电子证照也已在多地推广使用，与纸质证照具有同等法律效力。

4. 法律效力：

   • 电子凭证的法律效力主要体现在其能够作为合法的证据使用，在诉讼、仲裁等法律程序中具有与纸质凭证相同的证明力。
   • 同时，电子凭证的存储、传输和查验也需符合相关法律法规的要求，确保其真实性、完整性和安全性。

综上所述，电子凭证在法律上具有明确的合法性，其法律效力与纸质凭证相当。在实际应用中，应遵守相关法律法规的规定，确保电子凭证的合法、有效使用。如有任何关于电子凭证的合法性问题或纠纷，欢迎随时向我咨询。