不会。别人银行卡留有你的手机号，在逾期的情况下，不会自动从你的银行卡中扣款。以下是对此问题的详细分析：
一. 自动扣款的前提与条件
持卡人明确授权与设置：通常情况下，银行卡或信用卡的自动还款功能需要持卡人明确授权并设置，如绑定银行卡进行自动还款。若未设置自动还款或未授权，银行不会擅自从其他银行卡中扣款。
手机号与扣款的关系：手机号在银行卡或信用卡的使用中，主要作为接收通知、验证码等信息的渠道，并不直接决定银行是否会自动扣款。因此，即使别人的银行卡留有你的手机号，也不会导致银行自动从你的银行卡中扣款。
二. 逾期后的处理流程
提醒与催收：逾期后，银行会依据贷款合同的协定，通过电话、短信等形式提醒借款人还款。若借款人未能在一定期限内还款，银行可能会采取进一步的催收措施。
法律途径：在逾期情况严重，且经过银行有效催收后仍未还款的情况下，银行可能会通过法律途径追究借款人的法律责任。这包括向法院提起诉讼，并在胜诉后申请强制执行借款人的财产。
三. 不同银行间的扣款权限
同一家银行的情况：若逾期银行卡与待扣款银行卡属于同一家银行，且持卡人设置了自动还款功能，银行可能会从待扣款银行卡中自动扣款以偿还逾期债务。但这仍然需要持卡人的明确授权和设置。
不同银行的情况：若逾期银行卡与待扣款银行卡属于不同银行，除非经过法律程序（如法院判决、执行等），否则银行无权直接从其他银行的银行卡中扣款。
四. 法律依据
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，借款人未按照约定的期限返还借款的，应当按照约定或者国家有关规定支付逾期利息。但这并不意味着银行会自动从其他未授权的银行卡中扣款。法律并未赋予银行擅自从其他未授权银行卡中扣款的权利。
综上所述，别人的银行卡留有你的手机号，在逾期的情况下，不会自动从你的银行卡中扣款。银行扣款需要遵循法律程序和持卡人的授权。如有进一步需要，您可以继续咨询我。