起诉意见书、起诉书和公诉意见书在刑事诉讼中具有不同的功能和作用，以下是它们之间的主要区别：

1. 定义与性质：

   • 起诉意见书：是公安机关在侦查终结后，认为犯罪事实清楚，证据确实、充分，依法应当追究犯罪嫌疑人刑事责任时，向同级人民检察院移送审查起诉时制作的法律文书。它属于侦查文书，是公安机关对案件侦查结果的总结和对犯罪嫌疑人处理意见的提出。
   • 起诉书（又称公诉书）：是人民检察院经侦查或审查确认被告人的行为构成犯罪，依法应当交付审判时，向人民法院提起公诉的法律文书。它属于司法文书，是人民检察院代表国家向法院提起诉讼的正式文件。
   • 公诉意见书：是出席第一审法庭的公诉人，代表人民检察院，在法庭调查结束后，依法首先发表的支持公诉的意见。它属于法庭审理文书，是公诉人在法庭上阐述公诉理由和法律根据的发言稿。

2. 制作主体与适用阶段：

   • 起诉意见书：由公安机关制作，适用于侦查终结后，移送审查起诉前。
   • 起诉书：由人民检察院制作，适用于审查起诉终结后，决定提起公诉时。
   • 公诉意见书：由人民检察院（具体由出庭的公诉人撰写）制作，适用于法庭审理过程中，法庭调查结束后。

3. 内容侧重点：

   • 起诉意见书：内容全面反映案件侦查过程和结果，包括案件来源、立案情况、破案经过、犯罪嫌疑人基本情况、犯罪事实、证据材料、法律依据和处理意见等，提出对犯罪嫌疑人的处理意见。
   • 起诉书：内容明确指控被告人的犯罪事实和罪名，包括被告人基本情况、案由和案件来源、案件事实、起诉要求和根据等，提出具体的诉讼请求和法律依据。
   • 公诉意见书：内容针对被告人的犯罪事实和证据进行法律分析，包括法庭调查的简要概括、证据的分析论证、定罪量刑的意见、法律依据和结论等，阐述公诉理由和量刑建议。

4. 法律效力与作用：

   • 起诉意见书：作为公安机关向检察机关移送案件的依据，不具有直接的法律效力，但为检察机关审查起诉提供材料和参考意见。
   • 起诉书：具有启动审判程序的法律效力，是人民法院受理案件并进行审理的依据，明确指控被告人的犯罪事实和罪名，请求法院依法审判。
   • 公诉意见书：作为公诉人在法庭上的发言稿，不具有独立的法律效力，但帮助法庭查明案情，正确适用法律，准确定罪量刑；同时教育群众，增强法制观念。

综上所述，起诉意见书、起诉书和公诉意见书在刑事诉讼中各自扮演着不同的角色，具有不同的功能和作用。它们共同构成了刑事诉讼程序的重要组成部分，确保了案件的公正、合法和有效处理。