非营运机动车超员的处罚主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关法规，包括罚款和记分两方面的处罚。具体处罚力度根据超载情况而定，超载越严重，处罚越严厉。
一、法律依据与罚款处罚
一般超载情况：
- 非营运载客汽车载人超过核定人数未达20%的，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，通常会处以警告或者罚款20元以上200元以下。同时，参照该法第九十二条，也可能处二百元以上五百元以下罚款。
超载20%及以上：
- 非营运载客汽车超载20%以上的，依据《道路交通安全法》第九十二条，处五百元以上二千元以下罚款。
面包车超员：
- 若面包车超员还涉及非法营运，除超员处罚外，还会依据《中华人民共和国道路运输条例》等相关法规对非法营运行为进行处罚，一般是处违法所得2倍以上10倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足2万元的，处3万元以上10万元以下的罚款。
地方实施细则：
- 各地在具体执行过程中，会根据本地实际情况制定一些实施细则，处罚标准可能会略有差异，但总体在法律规定的框架范围内。
二、记分处罚
- 根据道路交通安全违法行为记分分值的相关规定：
- 超载未达20%：驾驶证一次记3分。
- 超载20%以上：驾驶证一次记6分。
三、其他注意事项
严重超员情况：
- 如果非营运车辆超员情况非常严重，如超员50%以上，虽然具体法律条文中没有明确提及，但根据实际情况和相关法律原则，处罚力度可能会更加严厉，包括但不限于高额罚款、吊销驾驶证等措施。
运输单位责任：
- 运输单位的车辆若存在超员情况且经处罚不改，对直接负责的主管人员也可能面临罚款等法律责任。
综上所述，非营运车辆超员是严重的交通违法行为，不仅危及行车安全，还可能引发严重的法律后果。驾驶人员应严格遵守道路交通安全法规，确保行车安全，避免超载等违法行为的发生。同时，运输单位也应加强车辆管理，防止超员情况的发生，确保乘客的生命财产安全。如有任何疑问或需要进一步了解相关法律问题，请直接向我咨询。