在非法集资案件中，关于本金扣除已支付利息的问题，我可以给你一个明确的解答。
在非法集资诈骗案件中，已支付的利息通常不从诈骗数额中扣除，但在量刑时可能会作为酌定从轻处罚的情节予以考虑。
具体来说：
集资诈骗数额的认定：
- 集资诈骗的数额以行为人实际骗取的数额计算。
- 如果利息是在本金中预先扣除的，应当按照实际收到的本金数额认定集资诈骗数额。
- 如果是事后支付利息的，这部分利息不应从诈骗数额中扣除。
已支付利息在量刑时的考虑：
- 在量刑时，对于案发前积极退还集资款及利息的，可以作为酌定从轻处罚情节予以考虑。
- 但这并不改变诈骗数额的认定方式，诈骗数额仍然以实际骗取的数额为准。
特殊情况的处理：
- 如果已付利息超过了本金，超出部分一般会被认定为对本金的偿还。在计算最终应退赔金额时，超出部分的利息应予以扣除。
- 若集资参与人获得的高额回报是通过犯罪手段取得，即便已超过本金，该部分也可能被依法追缴。
综上所述，非法集资诈骗案件中的本金和已支付利息的处理是一个复杂的问题，需要根据具体情况进行具体分析。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，建议尽快咨询专业的律师，以便更好地维护自己的合法权益。