离婚时，夫妻在股份有限公司所持有的股份分割是一个相对复杂的问题，需要根据具体情况采取不同的处理方式。以下是对这一问题的详细解答：
一、股份分割的基本原则
首先，要明确的是，如果股份属于夫妻共同财产，那么在离婚时应当进行分割。分割的基本原则是双方协商，如果协商不成，则由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则进行判决。
二、股份分割的具体方式
协商分割：
- 如果夫妻双方能够就股份分割问题达成一致，那么可以按照双方商定的方案进行分割。这可能包括一方继续保留股权，同时向另一方支付相应的经济赔偿金等情况。
法院裁决：
- 如果夫妻双方无法就股份分割问题达成共识，或者在市值评估基础上进行分配存在困难，那么人民法院将依据财产的实际状况，依法作出裁决。
股权转让：
- 如果公司允许非原始股东的配偶加入为新股东，并且其他股东也表示同意转让并放弃优先购买权，那么股权可以通过直接转让的方式进行分割。
作价补偿：
- 如果夫妻中的一方持有股权，而另一方不愿或无法成为股东，那么可以将股权折算成现金后，以货币形式支付给另一方。
拍卖分割：
- 在特定情形下，如果夫妻双方均无意愿继续持有股权，那么股权可以通过公开拍卖的方式进行分割。
三、法律依据
- 《民法典》第一千零八十七条明确规定：离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
- 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第七十二条也指出：夫妻双方分割共同财产中的股票、债券、投资基金份额等有价证券以及未上市股份有限公司股份时，协商不成或者按市价分配有困难的，人民法院可以根据数量按比例分配。
四、特殊情况处理
- 如果夫妻双方均具备经营才能并且不放弃共同经营的愿望，可以依据相关法律法规来直接划分持有的公司股权。
- 如果夫妻二人均主张解散公司并展开清算工作，那么在清算活动完成后，应当根据法律规定对公司剩余财产进行合理分配。
- 如果只有夫妻中的一方希望留在公司，而另一方期望离开并索求补偿款，则可以考虑通过向第三方转移股权以达成妥协。
综上所述，离婚时夫妻在股份有限公司所持有的股份分割方式多种多样，具体采取哪种方式需要根据夫妻双方的具体情况和意愿以及公司的相关规定来确定。在处理这一问题时，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。