技术合同由科技管理部门进行认定。具体来说：

1. 认定主体：

   • 技术合同认定登记应由卖方（技术输出方）在其依法注册地区任选一个登记机构申报。
   • 每项合同只能登记一次，不能在一个或多个登记机构重复登记。
   • 涉外技术合同中，如外方为卖方，可以委托买方（需卖方出具授权委托书）在买方所在地进行认定登记。

2. 管理部门：

   • 科学技术部管理全国技术合同认定登记工作。
   • 省、自治区、直辖市和计划单列市科学技术行政部门管理本行政区划的技术合同认定登记工作。
   • 地、市、区、县科学技术行政部门设技术合同登记机构，具体负责办理技术合同的认定登记工作。

3. 申请流程：

   • 卖方需准备完整的技术合同文本及相关证明材料。
   • 将材料提交至当地科技管理部门或其指定的技术合同认定登记机构。
   • 科技部门对提交的材料进行审核，确认合同的真实性、合规性，以及技术内容是否符合规定。
   • 若合同符合所有要求，科技部门会出具技术合同认定登记证明。

4. 认定意义：

   • 对卖方而言，通过技术合同认定可以享受国家促进科技成果转化的税收优惠政策，如技术转让、技术开发及与之相关的技术咨询、技术服务免征增值税，还可能获得信贷支持、奖励等其他政策优惠。
   • 对买方而言，虽然不负责申请认定，但技术合同认定登记结果与其利益相关，可以作为技术交易的成本核算、技术引进的合规性等方面的重要参考。

综上所述，技术合同的认定主要由科技管理部门负责，卖方需携带相关技术合同文本及其他必要证明材料前往申请认定。如有更多关于技术合同认定的问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。