公安机关有权处理企业强占农民土地破坏树木的行为。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据我国相关法律规定，强占土地和破坏树木均属于违法行为。这些行为可能触犯《土地管理法》、《森林法》等法律法规，具体视行为性质和后果而定。
   • 若企业的行为构成犯罪，如非法占用农用地罪、破坏生产经营罪等，公安机关有权依法进行立案侦查，并追究相关责任人的刑事责任。

2. 公安机关的职责：

   • 公安机关作为国家的执法机关，负责维护社会治安秩序，保护公民的人身安全和财产安全。
   • 当企业实施强占土地、破坏树木等违法行为时，公安机关有权进行制止、调查，并依法对违法行为人进行处罚。

3. 处理流程：

   • 农民或相关权利人发现企业强占土地、破坏树木时，应及时向当地公安机关报案。
   • 公安机关接到报案后，会进行初步调查，如确认存在违法行为，将依法立案侦查。
   • 在侦查过程中，公安机关会收集证据，对涉案人员进行询问，并根据调查结果依法作出处理决定。

4. 其他救济途径：

   • 除了向公安机关报案外，农民或相关权利人还可以通过民事诉讼途径维护自己的合法权益。
   • 如向人民法院提起民事诉讼，要求企业停止侵权行为、赔偿损失等。

综上所述，公安机关有权处理企业强占农民土地破坏树木的行为。若您或您身边的人遭遇此类问题，建议及时向公安机关报案，并寻求专业法律帮助以维护自己的合法权益。