基础设施配套费不一定会直接在土地出让合同中注明。这主要取决于具体的合同约定以及地方政府的实践做法。下面我为您详细解释：

1. 作为土地出让价格的组成部分：

   • 在某些情况下，基础设施配套费被视为土地出让价格的组成部分，即价外费用。这时，它可能会在土地出让合同或附属协议中明确要求房企承担，并可能规定在出让环节或出让后支付。这种情况下，配套费与土地出让价格紧密相关，并可能直接影响契税、增值税和土地增值税的计算。

2. 作为政府性基金：

   • 另一种情况下，基础设施配套费是行政、地方性法规要求企业缴纳的政府性基金，用于城市基础设施建设，而非直接用于受让地块的一级开发。在这种情况下，配套费通常不会直接写入土地出让合同，而是依据行政协议（合同）或地方性法规来缴纳。这种费用不属于土地出让价款的组成，因此在契税、增值税和土地增值税的处理上也有所不同。

综上所述，基础设施配套费是否在土地出让合同中注明，取决于其具体性质和用途。如果是作为土地出让价格的组成部分，则可能会在合同中明确；如果是作为政府性基金，则通常不会直接写入合同。在实际操作中，建议您仔细审查土地出让合同及相关附件，并咨询当地政府部门或专业律师以获取更准确的解答。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。