父母的厂房可以通过合同转让给儿子，并且这种转让在有效履行相关法律程序后是有效的。

具体来说：

1. 转让途径：父母的厂房能够借助买卖等合法途径转让给儿子。这种转让行为实质上是一种财产转让，需要遵循财产转让的相关法律规定。

2. 合同签订：转让双方（即父母与儿子）通常需要签订书面的转让合同，以明确双方的权利与义务。合同中应详细载明厂房的价格、交付时间、产权变更等关键事宜，以确保转让过程的合法性和明确性。

3. 产权变更登记：办理产权变更登记手续是转让合法有效的关键环节。只有完成这一手续，厂房的所有权才能从父母名下转移到儿子名下。因此，在签订转让合同后，双方应尽快前往相关部门办理产权变更登记。

4. 真实性与合法性：在转让过程中，双方必须保证表意真实且合法，不存在欺诈、胁迫等违法情况。否则，转让行为可能会因违法而无效，甚至引发后续的法律纠纷。

5. 解除他项权利：如果厂房存在抵押等他项权利限制，那么在转让之前必须先解除这些限制。否则，这些他项权利可能会影响到转让的合法性和有效性。

综上所述，父母的厂房可以通过合同转让给儿子，并且这种转让在签订书面合同、办理产权变更登记、保证真实性与合法性以及解除他项权利等法律程序履行完毕后是有效的。如果您在转让过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。