即使结婚证丢失且没有档案，只要双方存在合法的婚姻关系，就仍然属于合法夫妻，可以依法办理离婚。下面我为您详细解释：
婚姻关系的合法性
婚姻关系的成立：根据《民法典》的相关规定，男女双方依法办理结婚登记手续后，即确立婚姻关系。这意味着，只要双方按照法定程序登记结婚，无论结婚证是否丢失，都不影响婚姻关系的合法性。
结婚证的证明作用：结婚证是婚姻关系的重要证明文件，但它并非婚姻关系的唯一证明。在结婚证丢失或没有档案的情况下，可以通过其他方式（如证人证言、婚姻登记机构的证明等）来证明婚姻关系的存在。
离婚程序的办理
协议离婚：如果双方能够就离婚事宜达成一致意见，可以共同到婚姻登记机构办理离婚登记手续。在办理过程中，如果结婚证丢失，可以告知婚姻登记机构相关情况，并尝试提供其他证明材料来辅助证明婚姻关系。
诉讼离婚：如果双方无法就离婚事宜达成一致意见，或者存在其他复杂情况（如财产分割、子女抚养等争议），则可以通过诉讼方式向法院提起离婚诉讼。在诉讼过程中，法院会根据双方提供的证据和陈述来审理案件，并依法作出判决。
建议与注意事项
尽量寻找证明材料：虽然结婚证丢失，但尽量寻找其他能够证明婚姻关系的材料，如婚姻登记机构的证明、亲友的证人证言等。这些材料在办理离婚手续时可能会起到重要作用。
咨询专业意见：在办理离婚手续过程中，如果遇到复杂情况或疑问，建议及时咨询专业律师或法律机构，以获取准确的法律意见和帮助。
综上所述，即使结婚证丢失且没有档案，只要双方存在合法的婚姻关系，就仍然属于合法夫妻，并可以依法办理离婚手续。在办理过程中，尽量寻找证明材料来辅助证明婚姻关系，并咨询专业意见以确保程序的顺利进行。