城乡公交一体化由一家公司运营，并不必然违反公平竞争审查标准。具体分析如下：

1. 公平竞争审查标准的核心：公平竞争审查标准主要是为了预防和制止行政机关和法律、法规授权的具有管理公共事务职能的组织滥用行政权力，排除、限制市场竞争的行为。它关注的是市场竞争是否受到不合理的限制或扭曲。

2. 城乡公交一体化的运营模式：城乡公交一体化通常是为了提高公共交通服务效率，实现城乡交通的无缝对接。由一家公司运营可能是出于资源整合、提高效率、减少重复建设等考虑。这种运营模式本身并不直接等同于排除或限制竞争。

3. 是否违反公平竞争审查标准的判断：

   • 如果这家公司的运营是基于公开、透明、非歧视性的原则，且没有滥用市场支配地位或采取其他不正当手段排除、限制竞争，那么这种运营模式就不违反公平竞争审查标准。
   • 然而，如果这家公司通过不正当手段获得了独家运营权，或者利用其市场支配地位进行不公平的竞争行为，如价格歧视、拒绝交易、搭售等，那么就可能违反公平竞争审查标准。

4. 法律建议：

   • 对于政府而言，在推进城乡公交一体化时，应确保运营模式的公开、透明和公平性，避免滥用行政权力排除、限制竞争。
   • 对于企业而言，应遵守相关法律法规和公平竞争原则，不得利用市场支配地位进行不正当的竞争行为。
   • 对于消费者而言，如认为城乡公交一体化的运营模式存在不公平竞争行为，可以向相关部门举报或寻求法律援助。

综上所述，城乡公交一体化由一家公司运营并不必然违反公平竞争审查标准，关键在于运营模式的公开、透明和公平性，以及是否遵守相关法律法规和公平竞争原则。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。