关于承包人应保留多少工程款作为保修费用，这个问题并没有一个固定的答案，而是需要根据具体情况来确定。以下是我根据相关法律法规和实务经验给出的详细解答：
结论前置：建设工程质量保修金的具体数额由发包人与承包人在合同中约定，且总预留比例不得高于工程价款结算总额的3%。
一、保修金的法律规定
根据《建设工程质量保证金管理办法》的规定，发包人应按照合同约定方式预留保证金，保证金总预留比例不得高于工程价款结算总额的3%。如果合同双方约定以银行保函替代预留保证金，那么保函的金额也不得超过这个上限。
二、影响保修金比例的因素
工程性质和规模：例如，大型基础设施如高速公路、大型桥梁等，由于建设成本高、技术复杂，保修金可能会相对较高，但仍需控制在3%以内。而小型建筑工程如普通住宅楼，保修金金额则相对较低。
工程风险程度：如果工程采用了新技术、新材料或新工艺，由于质量风险较高，发包人可能会要求预留较高比例的保修金。相反，如果工程采用常规技术和工艺，保修金比例可能会适当降低。
承包方信誉：承包方的信誉和经验也会影响保修金的比例。信誉良好、经验丰富的承包方可能享受较低的保修金比例，而新进入市场或有不良记录的承包方，发包人可能会提高保修金比例以保障自己的权益。
三、保修金的计算方式
保修金通常是根据工程价款结算总额乘以双方约定的保修金比例来计算。例如，如果工程价款结算总额为1000万元，双方约定保修金比例为2%（不超过法定上限），那么保修金金额就是1000万元×2%=20万元。
四、实务建议
在处理与建设工程质量保修金相关的问题时，建议双方仔细审查合同条款，确保保修金的约定符合法律法规的规定，并充分考虑工程实际情况和双方利益。如果合同中没有明确约定保修金的比例或计算方式，双方应协商确定，并签订补充协议以明确相关事宜。
总之，承包人应保留多少工程款作为保修费用是一个需要根据具体情况来确定的问题。双方应遵守相关法律法规的规定，并在合同中明确约定保修金的比例、计算方式及返还条件等关键条款，以确保双方的权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。