高新企业伪造研究项目负责人的后果可能非常严重，包括但不限于取消高新技术企业资格、追缴税款、以及可能的刑事责任。以下是对此问题的详细分析：
取消高新技术企业资格：
- 高新技术企业认定是基于企业真实的科研实力、创新能力以及财务状况等多方面因素的综合评估。一旦发现有伪造研究项目负责人等弄虚作假行为，相关部门将取消其高新技术企业资格，这意味着企业将失去享受高新技术企业所得税减免、研发费用加计扣除等一系列优惠政策的资格。
追缴税款及罚款：
- 伪造研究项目负责人骗取国家补贴或税收优惠，属于违法行为。一旦查实，相关部门将追缴企业已享受的税费优惠，并可能对企业处以罚款，以惩罚其违法行为并维护国家税收秩序。
刑事责任：
- 如果伪造研究项目负责人的行为构成犯罪，如诈骗罪等，企业相关负责人将面临刑事追究。根据具体案情，责任人可能被判处有期徒刑、罚金等刑罚。例如，在某案例中，相关负责人因伪造申报材料骗取国家补贴被判刑3年，并处罚金。
对企业声誉的影响：
- 伪造研究项目负责人等违法行为不仅会影响企业的法律地位和经济利益，还会严重损害企业的声誉和信誉。这可能导致客户流失、合作伙伴解约等连锁反应，对企业的长期发展造成不利影响。
综上所述，高新企业伪造研究项目负责人的后果是极其严重的。因此，企业应严格遵守相关法律法规和规定，确保申报材料的真实性和准确性。如果企业在申报过程中遇到任何问题或疑问，应及时咨询专业律师或相关机构以获取准确的法律意见和指导。