撤回起诉后，卷宗的处理方式主要取决于案件的具体情况以及相关的法律规定。以下是对撤回起诉后卷宗处理方式的详细解答：

一、撤回起诉的基本含义与后果

撤回起诉是指人民检察院在案件提起公诉后，人民法院作出判决前，因出现一定法定事由，决定对提起公诉的全部或者部分被告人撤回处理的诉讼活动。撤回起诉后，如果被告人在押，应当立即释放。同时，检察机关需要在法定期限内对案件作出进一步处理。

二、卷宗的处理方式

1. 不起诉处理：

   • 在撤回起诉后，检察机关可以根据案件的具体情况，依法作出法定不起诉或存疑不起诉处理。
   • 如果检察机关决定不起诉，那么卷宗将按照不起诉案件的程序进行归档和管理。

2. 重新起诉：

   • 如果检察机关在撤回起诉后补充到了新的事实或证据，并且符合起诉条件，那么可以重新向法院提起公诉。
   • 在这种情况下，卷宗将随着新的起诉程序再次进入法院，并作为案件审理的重要依据。

3. 退回补充侦查：

   • 虽然撤回起诉后原则上不应再退回补充侦查，但在某些特殊情况下，如果检察机关认为案件需要进一步调查或侦查，可以在作出不起诉决定后将案卷材料退回监察机关或公安机关，建议其重新调查或侦查。
   • 退回的卷宗将作为重新调查或侦查的参考依据，并在调查或侦查结束后再次提交给检察机关进行审查。

三、注意事项

• 撤回起诉后的卷宗处理必须严格遵守相关法律规定和程序要求，确保案件的合法性和公正性。
• 检察机关在撤回起诉后需要对案件进行全面审查，并根据案件的具体情况作出合理的处理决定。
• 卷宗的处理过程中需要注重保护当事人的合法权益，确保当事人的知情权、参与权和申诉权得到充分保障。

综上所述，撤回起诉后卷宗的处理方式需要根据案件的具体情况和相关法律规定来确定。检察机关在撤回起诉后应对案件进行全面审查，并依法作出合理的处理决定，确保案件的合法性和公正性。