不能私自扣押工作人员操作证。

从法律角度来看，操作证是工作人员的职业资格证明，属于其个人财产，受到法律的保护。任何单位或个人都无权非法扣押或留置他人的个人财产，包括操作证。如果私自扣押了工作人员的操作证，可能会构成侵犯他人财产权的行为，需要承担相应的法律责任。

在具体操作中，如果因为某些原因需要暂时保管或扣留操作证，应该遵循合法的程序和规定。例如，如果是因为工作人员违反了公司规定或法律法规，需要对其操作证进行暂扣或吊销，应该由相关部门或机构依法进行，而不是由个人私自扣押。

因此，建议遵守法律法规，尊重他人的财产权，不要私自扣押工作人员的操作证。如果有任何纠纷或问题，应该通过合法的途径和方式进行解决。