对于一名54岁的男子开始缴纳社保，首先他需要了解的是，作为灵活就业人员，他有两种基本养老保险制度可以选择：以个人身份参加企业职工基本养老保险，或在户籍地参加城乡居民基本养老保险。

如果他选择参加企业职工基本养老保险，他需要承担全部的缴费。他可以在参保地所在省全口径城镇单位就业人员平均工资的60%～300%之间选择适当的缴费基数，缴费比例为20%。他可以选择按月、按季度、按半年、按年等方式进行缴纳。这种方式的好处是，达到法定退休年龄且满足最低缴费年限条件后，他可以按月领取基本养老金，且享受的待遇与企业职工一样。

如果他选择在户籍地参加城乡居民基本养老保险，他需要按年、按档次进行缴费，缴费档次按照当地人社部门公布的数额为准。

对于如何办理参保手续，他可以携带本人身份证（居住证）或社保卡等材料，到参保地社保经办机构办理。此外，他还可以选择就近的街道（乡镇）便民服务中心、社银合作网点进行办理。在缴费方式上，他既可以通过线上渠道如电子税务局、微信支付、支付宝等进行缴费，也可以通过线下渠道如办税服务厅、银行网点等进行缴费。

总的来说，对于一名54岁的男子，开始缴纳社保是一个明智的选择，可以为他的未来提供一定的经济保障。在选择社保类型和缴费基数时，他应根据自己的实际情况和经济能力进行合理选择。