个人自费商业补充险是可以在医保报销后进行报销的。这种保险形式通常被看作是对基本医疗保险的一种有力补充。

在报销的过程中，需要遵循先医保后商业保险的原则。也就是说，首先需要通过医保进行报销，然后再将医保未报销的部分，通过商业医疗保险进行报销。具体操作时，参保人需要把医保未报销的票据，即医保打的分割单，提交给商业保险公司进行报销。如果原始单据只有一份，那么医保报销可以使用原件，而商业医疗保险则可以使用复印件。

需要注意的是，不同的商业医疗保险其报销范围可能会有所不同。部分商业医疗保险的保险合同可能会规定，只有实际医疗费用在医保报销范围内的部分才能进行报销。因此，在购买商业医疗保险前，一定要仔细阅读并理解保险合同的内容。

另外，如果购买的商业保险是报销型的，如住院津贴、手术津贴类的保险，这类保险通常是基本医保的补充，用于按比例报销医保不保部分的医疗费用。但无论是基本医疗保险还是商业医疗保险，其报销的总额加起来是不能高于实际花费的医疗费总数的。而如果购买的是重大疾病给付型的商业保险，那么在发生合同规定的重大疾病时，保险公司会一次性赔付合同规定的保额给被保险人。