二级医院与三级医院在医保报销比例上确实存在差异。一般来说，二级医院的报销比例会高于三级医院。这是因为医保政策鼓励患者优先选择基层医疗机构就诊，以优化医疗资源分配。

具体来说，不同级别的医院设有不同的起付标准和报销比例。通常，三级医院的起付标准较高，报销比例相对较低；而二级医院的起付标准较低，报销比例则相对较高。这样的设置旨在引导患者在病情允许的情况下，首先在二级医院等基层医疗机构接受治疗，从而减轻三级医院的诊疗压力。

然而，需要注意的是，具体的报销比例还会受到医保类型（如职工医保与居民医保）、医疗费用项目、医保政策变化以及地区差异等因素的影响。因此，为了获取最准确的报销比例信息，建议您咨询当地的医保部门或查阅相关医保政策文件。

在选择就医机构时，除了考虑报销比例外，还请您综合考虑医疗质量、专业水平、服务态度以及自身病情等因素，以确保获得最佳的治疗效果。