一般纳税人公司出售二手车时，涉及的税种和税率主要根据车辆的购入时间、是否取得增值税抵扣凭证以及具体的销售情况来确定。以下是对各税种及税率的详细解答：

一、增值税

1. 适用税率征收：

   • 若销售的二手车是2009年1月1日以后购入的，并且取得了有效的增值税抵扣凭证（例如增值税专用发票），则需按照当前适用的税率（一般为13%）计算缴纳增值税。计算公式为：应纳税额 = 含税销售额 ÷（1 + 13%）× 13%。
   • 特别注意的是，对于营改增之后购置并用于生产经营的汽车，后续出售时也需按此税率缴税。

2. 简易办法征收：

   • 若销售的是2008年12月31日以前购入或未取得有效增值税抵扣凭证的二手车，可按简易办法依3%征收率减按2%征收增值税。计算公式为：应纳税额 = 含税销售额 ÷（1 + 3%）× 2%。
   • 纳税人也可选择放弃减税，按照简易办法依照3%征收率缴纳增值税。计算公式为：应纳税额 = 含税销售额 ÷（1 + 3%）× 3%。

此外，还需注意自2020年5月1日至2023年12月31日的特别规定：从事二手车经销的纳税人销售其收购的二手车，减按0.5%征收增值税。但这一规定仅适用于按规定从事二手车经销业务并办理过户登记的纳税人。

二、附加税

附加税包括城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加，它们以实际缴纳的增值税税额为计税依据：

• 城市维护建设税：税率根据纳税人所在地不同而异，市区为7%，县城、镇为5%，不在市区、县城或镇的为1%。
• 教育费附加：征收率为3%。
• 地方教育附加：征收率通常为2%。

三、企业所得税

公司出售二手车取得的收入应计入企业的收入总额，在扣除相关成本、费用和税金后，按照企业适用的企业所得税税率（一般为25%）计算缴纳企业所得税。若企业符合小型微利企业条件，还可享受相应的税收优惠政策。

四、印花税

出售二手车时，若签订了买卖合同或类似文件，且该合同属于印花税应税凭证范围，则需按合同金额的万分之五缴纳印花税。但需注意，自2018年5月1日起，对部分印花税应税凭证有减半或免征的规定，具体需根据合同内容和当地税务部门规定确定。

综上所述，一般纳税人公司在出售二手车时，应综合考虑车辆购入时间、是否取得增值税抵扣凭证以及具体的销售情况等因素，准确计算各税种应纳税额，并确保合规缴纳，以避免潜在的税务风险。建议公司在出售前咨询当地税务部门或专业税务顾问，以确保准确理解和遵守相关税收政策。