关于专项资金使用存在的问题，以下是我根据专业知识和实践经验总结出的几点常见问题及建议：
一、专项资金使用存在的常见问题
未单独核算：
- 部分单位将专项资金与单位基本经费混合核算，未按照专款专用的原则进行单独核算，导致资金用途不明，难以追踪。
被挤占挪用：
- 专项资金常被用于弥补单位行政经费不足，特别是被挪用于“三公经费”等开支，严重违背了专项资金的原定用途。
结余过大且未及时处理：
- 专项资金使用后存在大量结余，但单位未按照相关规定及时对结余资金进行清理和上缴，导致资金长期挂账，未能有效发挥资金使用效益。
审批不严谨：
- 专项资金的审批流程相对宽松，缺乏像单位基本经费那样的严格审批机制，导致资金使用过程中存在较大的灵活性和随意性。
跟踪问效机制缺失：
- 专项资金的使用缺乏有效的跟踪问效机制，管理部门和使用部门普遍关注资金使用的合规性，而忽视了对资金使用效益的评估和监督。
二、针对上述问题的建议对策
严控专项资金核算关口：
- 各级、各部门应严格按照专款专用的原则，对专项资金进行单独核算，确保资金用途清晰、可追溯。
强化资金使用监管机制：
- 建立健全专项资金支出的审批制度，加强资金使用的监督和管理，确保资金按照申报要求使用，不得挪作他用。
严把专项资金结余关口：
- 财政、审计等部门应加强对专项资金结余的监管，督促单位及时清理和上缴结余资金，提高资金使用效益。
严格专项资金审批关口：
- 细化专项资金的审批流程，比照单位基本经费的审批标准，确保资金使用的合理性和规范性。
建立专项资金跟踪问效机制：
- 对专项资金的使用效益进行定期评估和跟踪，将评估结果作为下年度专项资金分配的重要依据，促进资金使用的高效和透明。
综上所述，专项资金使用存在的问题涉及核算、监管、审批和效益评估等多个方面。为解决这些问题，需要各级、各部门共同努力，建立健全相关制度和机制，确保专项资金能够按照原定用途高效、规范地使用。如果您在专项资金使用方面遇到具体法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。