一般纳税人销售废品时，其纳税方式主要依据《财政部 税务总局关于完善资源综合利用增值税政策的公告》（财政部 税务总局公告2021年第40号）进行。以下是对您问题的详细解答：
一、纳税方式的选择
简易计税方法：
- 再生资源回收的增值税一般纳税人，可以选择适用简易计税方法，依照3%征收率计算缴纳增值税。
- 选择简易计税方法后，一经选择，36个月内不得变更。
一般计税方法：
- 如果一般纳税人未选择简易计税方法，则适用一般计税方法计算缴纳增值税。
二、适用简易计税方法的条件
一般纳税人选择适用简易计税方法，需要符合以下条件之一：
- 从事危险废物收集的纳税人，应取得危险废物经营许可证。
- 从事报废机动车回收的纳税人，应取得报废机动车回收拆解企业资质认定证书。
- 除危险废物、报废机动车外，其他再生资源回收纳税人应符合国家商务主管部门出台的再生资源回收管理办法要求，并进行市场主体登记及在商务部门完成再生资源回收经营者备案。
三、选择计税方式的考量因素
- 增值税税负：如果回收再生资源业务综合增值税税负低于3%，可能更适合选择一般计税方法；如果税负高于3%，则可能更适合选择简易计税方法。
- 生产经营需要：根据企业的实际经营情况和未来发展需求来选择适合的计税方式。
四、特殊规定
- 对于小额零星经营业务的自然人，即每次（日）销售额在300-500元（含本数）的自然人，其纳税规定有所不同，具体依据当地税务部门的规定执行。
- “反向开票”业务模式下，对于年销售额不超过500万元（不含增值税）的出售者，如果无法获取完整、准确的成本费用资料，主管税务机关可以在一定时间内采用核定应税所得率方式征收个人所得税，应税所得率从低确定为5%。
五、注意事项
- 一般纳税人在选择计税方式时，应充分考虑自身的实际情况和税负情况，做出合理的选择。
- 在进行废品销售时，应确保合规开具发票，并妥善保管相关凭证，以备税务部门查验。
- 如果对纳税规定有疑问或不确定的地方，建议及时咨询当地税务部门或专业税务顾问，以确保合规纳税。
综上所述，一般纳税人销售废品时，可以根据自身情况和税负情况选择适用简易计税方法或一般计税方法计算缴纳增值税。同时，应遵守相关税收法规和规定，确保合规纳税。