交通运输综合执法大队的上级单位通常是当地的交通运输管理部门或者政府相关机构。具体来说：

1. 市级层面：在市级层面，交通运输综合执法大队可能直接归市交通运输局管理，或者由市交通运输局下属的某个具体管理部门（如运政管理处、路政管理处等）负责指导和管理。

2. 省级及国家级层面：在省级或国家级层面，交通运输综合执法大队的上级单位可能是省交通运输厅或交通运输部下属的相关执法机构或管理部门。

需要注意的是，不同地区的交通运输综合执法大队的上级单位可能有所不同，这取决于当地的具体行政架构和管理体制。如果你需要了解某个具体地区的交通运输综合执法大队的上级单位，建议直接咨询当地的交通运输管理部门或政府相关机构，以获取最准确的信息。

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