佣金收入作为劳务报酬所得，其个人所得税的计算确实需依据个人所得税法规定，并根据收入的金额及年度综合所得情况来确定具体税率。以下是对您问题的详细解答：

一、佣金个人所得税税率

佣金个人所得税的计算分为预扣预缴阶段和年度汇算清缴阶段，两个阶段适用不同的税率。

1. 预扣预缴阶段税率：

   • 佣金收入以收入减除费用后的余额为收入额。每次收入不超过四千元的，减除费用按八百元计算；每次收入四千元以上的，减除费用按收入的百分之二十计算。
   • 预扣预缴应纳税所得额及对应税率如下：
     • 不超过20000元，税率为20%；
     • 超过20000元至50000元的部分，税率为30%，速算扣除数为2000；
     • 超过50000元的部分，税率为40%，速算扣除数为7000。

2. 年度汇算清缴阶段税率：

   • 年度终了后，佣金收入需并入综合所得进行年度汇算清缴，适用超额累进税率。税率表如下：
     • 不超过36000元，税率为3%；
     • 超过36000元至144000元的部分，税率为10%，速算扣除数为2520；
     • 以此类推，最高税率可达45%。

二、关于您提到的退税问题

根据您提供的信息，您认为之前年度汇算时佣金收入部分扣除额少了，导致缴纳个税多了。针对这种情况，您可以考虑以下几点：

1. 核实收入情况：首先，请核实您的佣金收入是否确实存在扣除额不足的情况。这包括确认您的佣金收入金额、已扣除的费用以及实际应缴纳的税额。

2. 查阅相关政策：您提到的财政部、税务总局关于个人所得税法修改后有关优惠政策衔接问题的通知（财税〔2018〕164号）是一个重要的参考文件。请仔细阅读该文件，了解其中关于佣金收入扣除的具体规定。

3. 申请退税：如果您确实存在多缴税款的情况，可以向当地税务机关提出退税申请。在申请时，请提供相关的证明材料，如收入证明、已缴纳的税款证明等。

4. 咨询专业人士：由于税收问题相对复杂，建议您咨询专业的税务顾问或律师，以便更准确地了解您的权益和应采取的措施。

综上所述，佣金个人所得税的计算需综合考虑多个因素，包括收入金额、扣除费用以及适用的税率等。对于您提到的退税问题，建议您先核实收入情况并查阅相关政策，然后向当地税务机关提出退税申请或咨询专业人士以获取更准确的建议。