当您在上班途中发生事故且找不到第三方时，您可以采取以下措施来保障自己的权益：

首先，您可以考虑通过交强险来获得赔偿。交强险在财产损失方面设有一定的限额，通常为2000元。您需要及时向保险公司报案，并提交相关的证明材料，如事故证明、车辆维修清单等。保险公司会对此展开调查核实工作，一旦确定确实无法找到第三方，就会按照限额进行赔付。如果损失超过了交强险的限额，那么超出的部分就需要由您自己来承担。不过，如果后续找到了第三方，您还可以向保险公司申请追加赔偿。

另外，如果您的情况符合工伤认定的条件，您也可以考虑申报工伤。根据相关法律条文，当职工在上下班途中，遭受到并非由本人主要承担责任的交通事故时，应当被认定为工伤。此时，您可以由用人单位向社保经办机构提出工伤认定的申请。社保经办机构在进行详细的调查核实工作之后，如果认定该情况符合工伤认定的条件，就会予以认定为工伤，并按照规定向您支付相应的工伤待遇。

需要注意的是，如果能够找到第三方，并且第三方应当承担相应的赔偿责任，那么您首先应该向第三方主张赔偿权利。只有在第三方的赔偿金额不足以弥补您所遭受的损失时，才可以要求工伤保险基金来补足剩余的部分。

综上所述，当您在上班途中发生事故且找不到第三方时，一方面可以通过交强险来获得赔偿，另一方面也可以考虑在满足条件的情况下申报工伤。在处理过程中，您需要及时与保险公司和用人单位沟通，并按照相关要求提供相应的证明材料，以便更好地保障自己的权益。