对于个税补税金额不超过400元的情况，根据个人所得税法及其实施条例等相关规定，您实际上是不需要办理年度汇算的，也就是说，您不需要补交这笔税款。这是因为税法规定，对于年度取得综合所得年收入不超过12万元或者补税金额不超过400元的纳税人，是免除其年度汇算义务的。
不过，如果您还是想要通过系统确认一下或者了解一下具体的操作流程，以下是在手机APP上办理个税综合所得年度汇算时，针对补税金额不超过400元情况的操作指南：
打开个税APP：首先，您需要打开个人所得税手机APP，并登录您的账号。
进入汇算页面：在APP中，找到并点击“综合所得年度汇算”或相关入口，进入年度汇算的页面。
填写申报信息：按照页面提示，填写您的收入、扣除等申报信息。系统会根据您填报的信息，自动计算出您的“应补税额”或“应退税额”。
查看应补税额：当系统计算出应补税额后，如果金额不超过400元，并且您符合免予汇算的条件（即年度综合所得收入不超过12万元），您会在页面上看到相应的提示。
享受免申报：如果您符合免予汇算的条件，并且希望享受这一政策，您可以直接点击“享受免申报”的按钮。这样，您就不需要再补交这笔税款，也不需要完成后续的缴税流程。
需要注意的是，如果您在填报过程中发现存在扣缴义务人未依法预扣预缴税款的情况，或者通过作废、修改某些扣除项目导致填报的扣除金额与平时扣缴金额明显不符，那么您可能就不符合免予汇算的条件，需要按照正常流程进行汇算并补交税款。
总的来说，对于个税补税金额不超过400元的情况，您可以选择享受免申报的政策，无需补交税款。但如果您想要确认一下或者了解一下具体操作流程，可以按照上述步骤在手机APP上进行操作。