怀孕女职工能否申请停薪留职，这确实是一个涉及劳动权益的细致问题。首先，我们要明确的是，从法律层面来看，停薪留职并非一项法定的制度。这意味着，它并非像产假那样，是法律明确规定女职工可以享有的权益。

然而，法律对女职工的孕期、产期和哺乳期确实给予了特殊的保护。如果怀孕的女职工因为身体原因或其他合理考量，希望暂时离岗，那么她可以与用人单位进行深入的沟通和协商。在这个过程中，女职工可以提出自己的需求和理由，而用人单位则会根据自身的实际情况和运营需求来做出考量。

如果双方能够达成一致意见，那么建议签订一份详细的协议。这份协议应该明确停薪留职的具体期限、薪酬待遇（如果有的话）、以及双方的其他权利和义务。这样，既能够保障女职工的权益，也能够确保用人单位的合法权益不受损害。

但值得注意的是，用人单位并没有一定要同意停薪留职申请的义务。如果协商不成功，女职工仍然可以依法享受产假等法定的待遇。对于参加了生育保险的女职工来说，生育津贴会按照用人单位上年度职工月平均工资的标准，由生育保险基金来支付；而对于没有参加生育保险的女职工，用人单位则需要按照她产假前的工资标准来支付生育津贴。

综上所述，怀孕女职工能否申请停薪留职，主要取决于她与用人单位之间的协商结果。在协商过程中，建议女职工充分表达自己的需求和理由，同时也尊重用人单位的实际情况和运营需求。无论协商结果如何，女职工都应该依法享受自己应有的劳动权益。