在商业秘密民事侵权案件与刑事案件的衔接与协调上，主要可以从以下几个方面进行：

1. 案件性质的界定：

   • 首先，要明确案件是单纯的民事侵权还是涉嫌刑事犯罪。这需要根据商业秘密被侵害的具体情节、造成的后果以及侵害人的主观恶意等因素来综合判断。
   • 如果行为人的行为已经触犯了刑法关于侵犯商业秘密罪的规定，那么案件就应当转为刑事案件处理。

2. 证据的收集与转化：

   • 在民事案件中收集的证据，如果符合刑事案件的证据标准，可以直接转化为刑事案件的证据使用。
   • 同时，刑事案件的侦查过程中，也可以发现并收集新的证据，这些证据同样可以用于民事案件的审理。
   • 证据的收集应当遵循合法、客观、全面的原则，确保证据的真实性和证明力。

3. 程序的衔接：

   • 当民事案件在审理过程中发现可能涉嫌刑事犯罪时，应当及时将案件线索移送公安机关处理。
   • 公安机关立案侦查后，民事案件可以中止审理，待刑事案件处理完毕后再恢复审理。
   • 如果刑事案件已经作出判决，民事案件可以直接引用刑事判决中认定的事实和证据，作为民事判决的依据。

4. 法律适用的协调：

   • 在处理商业秘密民事侵权案件与刑事案件时，应当注意法律适用的协调性。
   • 民事侵权和刑事犯罪在构成要件、法律责任等方面存在差异，但两者在保护商业秘密的宗旨上是一致的。
   • 因此，在适用法律时应当注重两者之间的衔接和协调，确保法律适用的统一性和公正性。

5. 权益的保护与平衡：

   • 在处理商业秘密民事侵权案件与刑事案件时，还应当注重保护商业秘密权利人的合法权益。
   • 同时，也要平衡侵害人的合法权益，避免过度追究其责任而导致不公。
   • 这需要在具体案件中根据案件事实、法律规定以及社会公共利益等因素进行综合考虑和判断。

综上所述，商业秘密民事侵权案件与刑事案件的衔接与协调是一个复杂而细致的过程，需要司法机关、律师以及当事人等各方面的共同努力和配合。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。