毁林立案后发现嫌疑人死亡，一般情况下不会留下案底。下面我将从几个方面详细解释这个问题：

1. 案底的含义：

   • “案底”通常指的是一个人在公安机关或司法机关留下的犯罪记录或违法记录。这些记录通常会在个人的档案中长期保存，并可能影响个人的未来生活和职业发展。

2. 嫌疑人死亡对案件的影响：

   • 当毁林案件立案后，如果嫌疑人死亡，那么该案件在刑事程序上通常会终止。因为刑事程序需要针对活着的犯罪嫌疑人进行，嫌疑人死亡后，就无法再对其进行起诉、审判等程序。

3. 案底的形成条件：

   • 案底的形成通常需要经过法院的判决，确认个人有罪，并将这一信息记录在个人的档案中。如果嫌疑人死亡，且案件未经过法院判决，那么通常不会形成案底。

4. 特殊情况说明：

   • 虽然一般情况下嫌疑人死亡不会留下案底，但在某些特殊情况下，如嫌疑人死亡前已经经过法院的部分程序（如已经开庭但未宣判），或者嫌疑人的死亡与案件有直接关系（如自杀以逃避法律责任），那么可能会在个人档案中留下相关记录。但这些记录并不等同于传统意义上的“案底”。

综上所述，毁林立案后发现嫌疑人死亡，一般情况下不会留下案底。但需要注意的是，具体情况可能会因案件的具体情况和当地的司法实践而有所不同。如果你对此类问题有进一步的疑问或需要更详细的法律解释，可以直接向我咨询。