在办理退税时，如果发现配偶的信息查不到，您可以按照以下步骤进行处理：

首先，请确认您是否已经在个人所得税APP中正确填报了配偶的信息。您可以通过个税APP的“我的”页面，进入“家庭成员”查看是否有配偶的信息记录。如果尚未填报，您需要据实添加配偶信息并保存。

其次，如果您在填报专项附加扣除时涉及配偶信息，比如住房贷款利息、3岁以下婴幼儿照护、子女教育等，需要确保配偶信息在这些项目中也被正确填写。您可以通过个税APP的“办&查”页面，进入“专项附加扣除”的“填报记录”，选择对应的查询年度，检查各项填报记录中配偶信息是否准确。

• 如果发现配偶信息有误或未填写，您需要进行更正。例如，在住房贷款利息的填报记录中，如果“配偶情况”栏显示为“无配偶”而您实际上有配偶，您需要点击“修改”，然后上传对应的证明材料，确认修改后，再回到住房贷款利息填报详情界面，点击“修改”更正基本信息，最后确认修改。
• 如果您已经上传过证明材料或相关填报记录已经显示“有配偶”，并且这与您的实际情况相符，那么在个税汇算清缴时，您可以选择“继续”跳过相关提示，进行下一步操作。

最后，请确保在更正年度申报时，不存在审核中的退税。如果您的退税申请尚未审核完毕，建议您先撤销退税申请，再进行申报更正。

按照以上步骤操作后，您应该能够解决配偶信息查不到的问题。如果问题仍然存在，建议您联系当地税务部门或咨询专业税务人员以获取更详细的帮助和指导。