当您需要对已开具的发票进行红冲并重新开具时，涉及税务局的勾选操作主要发生在红冲后的重新开票环节以及可能的退税流程中。以下是根据您提供的信息整理的详细步骤：

发票红冲流程

1. 登录电子税务局：首先，您需要登录到电子税务局的官方网站或应用。

2. 查找并红冲发票：

   • 在“代开增值税发票”模块中，选择“代开发票查询”。
   • 点击“立即查询”，找到需要红冲的发票。
   • 选择“去红冲”，进入红冲环节。
   • 选择对应的“冲红原因”，核实发票信息无误后“提交”，等待税务人员审核。

3. 红冲完成：审核通过后，您可以在“代开发票查询”中下载红字发票。

红冲后重新开具发票

1. 新增发票申请：

   • 在“代开增值税发票”中新增申请。
   • 填写相应发票信息，确保新发票申请与原发票的“项目名称”相同，以便税款能够抵扣。

2. 勾选已缴纳税款：

   • 在“纳税信息确认”环节，系统会显示“可使用税款信息”。
   • 勾选相应的已缴纳税款数据，以用于支付新发票的税费。

3. 提交申请并等待审核：

   • 提交新发票申请后，等待税务人员审核。
   • 审核通过后，根据新发票金额与原发票金额的差异，系统可能会自动处理税款抵扣或要求您补缴税款。

可能涉及的退税流程

如果新发票金额小于原发票金额，且您选择不重新开具发票或已缴纳的税款有剩余，您可以申请退税：

1. 进入退税模块：

   • 点击“我要办税”——“一般退税管理”——“一站式退抵税(费)”。

2. 选择退税场景：

   • 在可选的退税场景中，选择“代开发票预缴退税”。

3. 维护退税账户：

   • 系统会自动检测是否已维护可退税的账户。
   • 如未维护，点击“确定”跳转至存款账户账号报告界面，新增并提交银行账户信息。

4. 填写退税申请：

   • 选择退款银行账户、退抵税方式，并填写退税申请理由。
   • 在待退税(费)明细中，选择原蓝字发票的相关信息，查询并勾选需要退税的数据。

5. 提交退税申请：

   • 核对退税金额无误后，上传必要的附报资料，并提交退税申请。
   • 提交成功后，您可以通过“我要查询”——“涉税信息查询”——“办税进度及结果信息查询”模块查询退税进度。

综上所述，发票红冲并重新开具在税务局的勾选操作主要集中在红冲后的重新开票环节，特别是勾选已缴纳的税款以用于支付新发票的税费。同时，如果涉及退税，还需要按照退税流程进行操作。希望这些步骤能够帮助您顺利完成相关操作。