当您的车辆被他人驾驶并因违章行为记满12分时，这确实是一个需要妥善处理的问题。以下是根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，为您提供的详细处理步骤及建议：
一、明确违章情况与责任人
查询违章记录：
- 建议您首先通过交通管理部门的官方网站、APP或亲自前往交警大队，查询详细的违章记录。这将包括违章时间、地点、违章代码、罚款金额以及是否有记录驾驶人信息等关键内容。
确定实际驾驶人：
- 根据查询到的违章记录，尝试确定具体的驾驶人。如果可能，与驾驶人沟通，说明违章情况及可能带来的后果，并要求其配合处理。
二、依法处理违章记录
驾驶人明确且同意配合：
- 如果驾驶人明确且愿意配合处理，那么驾驶人需携带其驾驶证、身份证以及您的车辆行驶证，一同前往交警大队接受处罚。这通常包括扣分和缴纳罚款。
驾驶人无法确定或拒绝配合：
- 在驾驶人无法确定或拒绝配合的情况下，作为车主，您可能需要先行承担违章责任。这包括缴纳罚款和接受扣分。您应前往交通管理部门填写交通违法当事人自愿接受处罚确认书，并在收到罚款行政处罚决定书之日起十五日内到指定银行缴纳罚款。
- 事后，您有权根据实际情况向实际驾驶人追偿。
特殊情况处理：
- 对于电子眼抓拍等无法直接确定驾驶人的违章，您在处理时需特别谨慎，以防后续发现实际驾驶人导致处理过程复杂化。
- 同时，请注意地方政策差异，如某些地区对于同一驾驶人处理多辆非本人车辆违章或多名驾驶人处理同一车辆违章有特别规定，旨在防止买分卖分等违法行为。
三、后续管理与预防
加强车辆管理：
- 处理完违章后，应加强对车辆的管理，确保车辆使用合规，避免再次发生类似情况。
签订书面协议：
- 建议您在将车辆借给他人使用时，签订书面借车协议。协议中应明确双方在车辆使用过程中的权利和义务，特别是违章处理责任，以保障您的合法权益。
定期查询违章信息：
- 养成定期查询车辆违章信息的习惯，及时发现并处理违章，避免违章积累过多造成不必要的麻烦。
关注保险问题：
- 了解您的车险条款，特别是关于驾驶人违法行为对保险赔偿的影响。如有需要，可咨询保险公司以获取更详细的信息。
综上所述，当车辆被他人驾驶并因违章行为记满12分时，您应首先明确违章情况和责任人，然后依法处理违章记录，并注意后续的管理和预防。通过采取一系列措施，您可以有效降低类似风险的发生。