针对您提出的问题“告公司的同时可以告拥有99%股权的股东吗”，我首先给出明确的结论：在某些情况下，告公司的同时确实可以告拥有99%股权的股东，但这取决于具体的法律关系和案件事实。

接下来，我将从几个角度详细分析这一问题：

1. 公司独立法人地位：

   • 公司作为独立的法人实体，通常对外独立承担法律责任。因此，当公司与他人发生纠纷时，一般应直接以公司为诉讼主体。
   • 股东，即便是拥有99%股权的大股东，通常不直接对公司对外的债务或法律责任承担责任，除非存在特定的法律情形，如股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的，应当对公司债务承担连带责任。

2. 特定法律情形下的股东责任：

   • 在某些特定情况下，如股东存在出资不实、抽逃出资、滥用股东权利等行为，且这些行为直接导致了公司对外承担的法律责任或债务，那么债权人或受损方在告公司的同时，也可以依据相关法律规定，将有过错的股东列为共同被告，要求其承担相应的法律责任。
   • 如果拥有99%股权的股东存在上述行为之一，且这些行为与您的诉讼请求有直接关联，那么您完全可以在告公司的同时，也将该股东列为被告。

3. 诉讼策略考虑：

   • 在实际诉讼中，是否同时告公司和股东，还需要根据具体的案件事实、证据情况以及诉讼策略来决定。
   • 有时候，单独告公司可能更有利于案件的审理和执行；而在某些情况下，将公司和股东同时列为被告，可能更能全面保护原告的合法权益。

综上所述，告公司的同时是否可以告拥有99%股权的股东，取决于具体的法律关系和案件事实。如果您有具体的案件或纠纷，建议详细咨询专业律师（如我），以便根据具体情况制定合适的诉讼策略。